研究可预测白血病药物反应及临床结局
研发家 | 2025-03-29 0

最近,中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)研究员陈昌亚和费城儿童医院教授谭凯联合宾夕法尼亚大学David T. 通过单细胞多组学习技术,Teachey团队对96例儿童白血病患者(包括急性髓系白血病AML/急性B淋巴细胞白血病B)数据进行了深入分析-ALLT淋巴细胞白血病/急性T-ALL/MPAL,一种急性混合表型白血病),首次在不同亚型中广泛存在于HSPC中。-like Blasts亚群,并且建立了分子特征图谱,可以预测化疗反应和临床结果。Blood发表了相关研究。

急性白血病是儿童最常见的恶性肿瘤。虽然近年来根据不同白血病治疗策略的研究取得了显著进展,但患者对预防的反应仍然存在较大差异。个性化治疗的关键是深入了解导致这种差异的分子机制。

以前的研究表明,白血病开始细胞(LICs)它在急性白血病的耐药性和复发性中起着关键作用。然而,不同白血病亚型之间的LICs形状和功能特征存在显著差异。由于目前对LICs的研究大多是基于小鼠模型,因此需要系统地探索LICs在不同白血病亚型中的异质性、可塑性和潜在靶点,依靠患者样本。

所以,研究人员对96例不同儿童白血病患者的骨髓/血细胞样本进行了scRNA-seq和scATAC-对seq信息进行整合分析,发现在各种白血病亚型中都有一种原始细胞状态,即HSPC。-like blasts。它在不同亚型中的频率是不同的,在B-ALL中也与特定的分子亚型有关。小鼠移植试验进一步证明了亚群患有白血病的能力。

随后,研究人员对HSPC进行了探索-like blasts是否与各种白血病的化疗抵抗有关。HSPC-like 在AML和T-ALL患者诱导治疗结束后,blasts频率与各种疾病风险指标相关,发现HSPC。-like 细微残留疾病的频率和频率(MRD)标准具有很强的正相关性。通过HSPC-like blasts和Lineage-like blasts对差异基因进行了分析,识别了一组泛白血病HSPC。-like 分子标志物blasts。与其它细胞群相比,HSPC-like blasts有独特的分子标志物,HSPCC可以通过这种泛白血病来治疗。-like blasts的特点是对病人的预后进行精确分层。

进一步结合scRNA-seq和scATAC-在HSPCC中,seq数据分析研究识别了6个。-like 关键转录因子在blasts中普遍上涨(例如HOXA3/5/9、AP-1、CEBPA),并且建立了包括45个靶基因在内的关键TRN网络。

最后,研究人员通过HSPC将HSPC-like 与公共药物靶点和功能数据库相比,blasts的特性基因选择了top30备选靶基因。在这些目标中,FLT3和BCL2是最高分数的潜在目标。体外药物实验证实,HSPC是6种针对这些目标的药物-like blasts有很好的杀伤效果。

研究人员表示,这项研究首次系统地从多组学习中分析了HSPC-like blasts通过生物信息预测与功能验证相结合,识别了治疗靶点和潜在药物,是儿童急性白血病中常见的性及其功能特征。为了了解白血病的异质性,提高治疗精度,促进临床转化提供了新的思路和技术路径。

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